должны ли совпадать номера счет фактур и т/н

Нет. Счета-фактуры выписываются в том числе и на авансы, без накладных. Да и не прописано такое правило нигде. Кто утверждает обратное, дайте ссылку на нормативный акт.

полностью согласна с Александрой

нет, не должны... в НК нет конкретного указания про нумерацию... хоть каждый месяц с 1 -го начинай.... просто сам запутаешься