ООО зарегистрировано в ЗАО г. Москвы. 31 налоговая. Подскажите, где находяться ФСС и ПФР, чтобы сдать туда отчетность.

Адреса посмотрите на официальный сайтах ФСС, налоговой и ПФР, там актуальная информация.

Читайте уведомительные письма с тих фондов. Там все есть. Штраф 1000 руб. за не сдачу только нулевого отчета в каждый фонд.