Подскажите, пожалуйста. Какую программу используют для создания графических персонажей. То есть как мультики.

Ты же не думаешь, что она одна? )
Начиная от фотошопа, иллюстратора для создания простеньких анимашек, до флэша (это по 2д) и по 3д - 3ds max, maya, 4dcinema, softimage xsi, еще с десяток проф. редакторовi и еще сотня более менее полупрофов (и тысячи мелкого софта с заточкой под конкретную задачу)