На флеш-карте при открытии исчезает файлы. Почему?

Да, это "работа" вируса.. .
А файлы на флешке есть, только они скрытые.

На флешке создайте любую папку. Затем извлеките флешку из компа и снова подключите. Если папка пропала, то с подключенной флешкой сделайте это, а потом это