УСН - это федеральный налологовый режим, в отличие от ЕНВД, который кроме НК РФ регулируется законом субьекта федерации (местным законом) .
Однако, кроме единого налога по УСН, вы являетесь налоговым агентом по НДФЛ с зарплаты работников и плательщиком взносов в ПФР, ФОМС, ФСС с зарплаты работников. Это предполагает, что Ваше обособленное подразделение в Москве (не филиал, не представительство) следует поставить на учет в ИФНС по адресу в Москве, где вам присвоют дополнительный КПП. Это влечет постановку на учет в Московском отделении ПФР и ФСС. Именно на счета московских отделений вы будете уплачивать НДФЛ и взносы от ФОТ по зарплате московских работников.
Площадка в Москве представительством ООО не является. Филиалы и представительства определяются в Уставе ООО и, как правило, наделяются самостоятельным балансом, данные которого попадают в консолидированный баланс всего ООО.