После вирусной атаки комп не видел сперва файлы на наружнем локальном диске, а после перезагрузки и его видеть перестал.

пуск -панель управления-управление дисками-находишь диск-присвоить букву-перезагрузка. Далее 1. Запустить проводник, включить показ скрытых и системных файлов: "Сервис" - "Свойства папки" - снять галку "Скрывать защищенные системные файлы" и отметить "Показывать скрытые файлы и папки".

2. Просмотреть корневые каталоги всех разделов на жестких дисках и всех имеющихся съемных дисков (, а также папку Windows\System32 и удалить там все файлы с именем autorun и любым расширением. Важно: открывать указанные места исключительно щелчком в левой части окна проводника, в дереве каталогов, а не двойным по иконке диска, ибо в последнем случае, открывая зараженный диск, опять заражаете комп.

3. Запустить редактор реестра (Пуск - Выполнить - regedit.exe) и сделать две вещи:

а) Раскрыть ключ
HKEY_LOCAL_MACHINE/Software/Microsoft/Windows NT/Current Version/Winlogon
и проверить значение параметра Userinit. В нем должно быть C:\WINDOWS\system32\userinit.exe, и ничего более.
(Если система у вас установлена в другой раздел или папку, вместо C:\WINDOWS будет путь вашей системной папки) .

б) Удалить целиком ключ
HKEY_CURRENT_USER/Software/Microsoft/Windows/Current Version/Explorer/MountPoints2.

Последний пункт повторить для всех пользователей системы, затем перезагрузиться.
и проверить на вирусы

Ну если систему влом переставить, то скачивай LiveCD и сканер порт. Загрузись с LiveCD и сканером через USB проверь комп на вирусы. Или отстегивай HDD и присоединяй его в качестве еще одного винта к другому системнику, далее проверяй антивирусником установленным на том компе. В этих двух случаях проверки система будет неактивна и вирусы убьются.