Зачем в локальной смете указывают з. п. машиниста отдельно, если она уже "сидит" в "эксплуатации машин"?

Смотря кто показывает.... Так делается для не особо посвященных, чтобы урвать лишнего, т. е. завысить стоимость объекта. Заметили такое, пусть переделывают.... Иначе, найдете другого подрядчика... Как говорится, сейчас монополистов и незаменимых нет.