Часть обонятельной области носа у кошек обособилась в так называемый орган Якобсона. С внешней средой его соединяют небольшие отверстия, расположенные за передними зубами. Поза кошки, которая при ориентации в окружающей среде использует орган Якобсона, довольно характерна. Она останавливается как вкопанная, открывает пасть и вдыхает воздух, втягивая губы и собирая кожу на голове в своеобразную «насмешливую» гримасу (улыбку Флемена) . Роль органа Якобсона до сих пор окончательно не ясна.
Существуют три основные гипотезы. Первая гипотеза отводит органу Якобсона роль информатора, специализирующегося на восприятии феромонов и других социальных запахов. Согласно второй — этот орган воспринимает запах пищи, поступившей в ротовую полость, как бы дополняя информацию о ней, полученную органом обоняния. Сторонники этой гипотезы считают, что животные, таким образом, обладают ротовым обонянием. Сторонники третьей гипотезы называют этот орган «шестым чувством» , позволяющим кошкам предсказывать катастрофические события (извержение вулкана, землетрясение, приближение лесного пожара и т. д.) , благодаря анализу воздушных потоков атмосферы, отражающих незначительные изменения химического состава воздуха.