Если модуль числа положительный, почему везде пишут /-5/=5?

Потому что -5 - это число, модуль которого надо найти и записывают его как /-5/, а 5 - это ответ. Ну или по другому говоря, модуль-это расстояние, а расстояние отрицательным быть не может.

В (-5) пишут в скобках, потому что это координата точки В

Да не за что)))