Можно ли принять к вычету НДС?

В декларации эта сумма пройдет в предыдущем периоде, когда произведена отгрузка, выписана накладная и счет-фактура. Если по какой то причине эта счет-фактура не попала в предыдущем периоде, то нужно внести ее в дополнительный лист Книги покупки и сдать уточненку.

Если ав отчет сотавлен в "следующем" налоговом периоде, то и к чету вы приняли товары (услуги) в следующем периоде.
Значит и зачет НДС - в след периоде.

именно когда выписана счет фактуры и принимается к вычету.

По ст. 172 НК РФ налоговый вычет осуществляется после принятия к учету имущества. Термин "принятие к учету" в целях чтения гл. 25 НК РФ не применяется, следовательно речь идет о принятии к бухгалтерскому учету.
Для справки: в гл. 25 есть перечень расходов, которые применяются в целях исчисления налога на прибыль по дате авансового отчета, но к ним не относятся МПЗ.
В целях б/у принятие к учету осуществляется на основании первичных документов. Я бы отнесла в данном случае к первичным документам авансовый отчет плюс к ТОРГ12 и сч-ф (он мог и через 3 месяца поступить, по внутриорганизационным правилам) и тогда вычет можно осуществить в периоде, когда датирован авансовый отчет.
Думаю, это не противоречит действующему законодательству, но уверена, что отстоять данное право на налоговый вычет в текущем периоде вы сможете только в суде, они будут апеллировать моментом перехода прав собственности при приобретении имущества:)

Да, не важно когда оплатили

вот тут почитайте:
http://www.klerk.ru/law/articles/34309/
http://www.taxpravo.ru/analytics/taxpravo/article213538012468627714923462066663756

Даже если вы авансовый отчет провели прошлым периодом и счет-фактура прошлым периодом Вы можете принять к вычету в следующем. Это не запрещено НК РФ. Но налоговая не всегда соглашается. Арбитражные суды не запрещают. Решайте сами.