Как правильно оформить докумены, чтобы не было проблем с налоговой.

Налоговую инспекцию может заинтересовать не возможность зачесть данную сумму как оплату услуги, а возможность считать данную сумму безвозмездным поступлением с соответствующим налогообложением налогом на прибыль.

В идеале - у вас должно быть 2 письма - от заказчика (о том, что оплату от третьей фирмы считать оплатой по счету..., договору... ) и от плательщика (о том, что ден средства по платежн поручению считать оплатой за фирму вторую по счету..., договору....)

вам без разницы, т. к. у вас доход. В платежке тех кто платил только должно быть указано за кого оплатили.

Так самое главное, та контора, которая за вас заплатила деньги той организации, в назначении платежа указала " За то то согласно письму за ООО " Ромашка" указите наименование своей организации

Вообще-то, как минимум, организация, на которую вы выставляли счет и та, от которой пришли деньги, должны быть как-то связаны между собой. Тогда нужно письмо от одной организации на имя другой с просьбой оплатить ваш счет по каким-нибудь причинам. Самое банальное - нет денег на расчетном счете.

Если они никак не связаны, то 2 варианта:
1. Удаляете реализацию первой организации и переделываете ее на вторую. Тут даже отчеты корректировать не надо. Все, что изменится - название покупателя. (Надеюсь, это в одном квартале было? )
2. Делаете еще одну реализацию на пришедшие деньги. Не важно, что работа одна и та же. Мало ли! ? Первая организация пусть заплатит еще раз. У них будут затраты, а вы лишнюю сумму им просто вернете налом. Потеряете на %, правда. .

Удачи!

Я так поняла, что это Вам пришли деньги от другой конторы? Если да, то в Вашей счет-фактуре должны быть заполнены следующие поля: Заказчик: фирма с которой заключен договор и Плательщик: фирма, которая оплатила работы. В договоре так же должно быть это прописано.