Вопрос о прибыли и НДС новообразовавшейся фирмы!

НДС указывается по первому событию. Вы не можете его показать через пол года, когда у вас понеслась прибыль. Вы обязаны его сразу показать. Насчет возмещения НДС вы правы, завернет, ну так на то и напористость, чтобы отстаивать свои права. Отправляйте еще раз декларацию только не походом в налоговую, а по почте с уведомлением.
Короче, вы должны все действия показать сейчас и требовать тоже сейчас

Показывать его в декларации как к возмещению и тупо проходить камералку.
Декларацию следует направлять ч/з Интернет, так же как ответы на требования и сами документы на КНП. Это также даст вам технологическое преимущество, так как налоговики полученные документы печататют и носятся уже с бумажными.
ТУПО - означает, что налоговики выпишут требование на КНП, как на выездную проверку. В ответ следует предоставить только Книгу Покупок, вх. счета-фактуры и приходные накладные, акты. - эти документы по ст. 172 НК РФ подтверждают вычеты, а по п. 8 ст. 88 НК РФ при камералке НДС они могут проверять только вычеты. Иные документы они требовать не вправе (п. 7 ст. 88).
Они могут принять решение о привлечение за непредставление иных документов из Требования - его следует оспорить в арбитражном суде - госпошлина 1000 руб (цена билета в кино) .

Вы только открылись. Цена вопроса не велика, но в итоге вы приобретете ценный опыт - как налоговики нарушают НК РФ и как с ними бороться. Это создаст вам репутацию, которая сыграет положительную роль в будущем. Вот увидите.