Как оплатить НДФЛ за работника если у ИП нет расчетного счета?

видимо Вы не заполнили бланк или оператору лень набирать реквизиты УФК и коды налогов, вот Вас и отправляет к терминалу. Если Вы знаете все реквизиты налоговой, то и сами можете ввести данные.

Оплата наличными
Нажмите на стрелку с надписью «Оплата наличными» в правом нижнем углу экрана

Выберите операцию «Платежи»
Выберите вид платежа (налоговые платежи)
Выберите получателя платежа (УФНС России по ...)
Введите идентификатор платежа.
• Идентификатор может быть введен вручную: 15-значный индекс документа (квитанции) , находящийся в левом верхнем углу документа.
• Идентификатор может быть считан автоматически: для этого необходимо поднести штрих-код документа к специальному считывающему устройству информационно-платежного терминала.
Нажмите «Продолжить»
Нажмите клавишу «Внести наличные» (минимальная сумма, которую можно внести через терминал – 10 рублей.
Переплата будет отнесена в счет предстоящих платежей по данному налогу) .
Внесите в купюроприемник наличные.
После внесения всей суммы нажмите клавишу «Продолжить» .
Внимательно проверьте правильность информации на экране. При отсутствии информации о Вашей задолженности, обратитесь к оператору банка.
Нажмите клавишу «Принять» . Если Вы решили отказаться от оплаты данной услуги и вернуться в Главное меню, нажмите «Другой платеж» .

а в налоговой такой платеж идентифицируют только по 15-значномуй индексу документа (квитанции) ?

а вообще я так поняла, что у автора вопроса нет квитанции из налоговой. Поэтому думаю лучше заплатить через операциониста, оформив квитанцию самому.

Нужны реквизиты куда платить и через кассу тогда заплатите легко. А реквизиты возьмите в налоговой.

а зачем счет? ТАК ЖЕ КАК И НАЛОГИ - по квитанции.