Если работник работает в фирме он с Красноярского края и фирма здесь выделяет ему деньги на оплату съемной квартиры

По НДФЛ: оплата организацией жилья является доходом, полученным сотрудниками в натуральной форме (пп. 1 п.2 ст. 211 НК РФ). Следовательно, этот налог необходимо удерживать со стоимости проживания. Такой ответ дали специалисты Минфина России в письме от 30.09.2013 № 03-03-06/1/40369.
Но кроме этого:
Если аренда жилья за счет работодателя предусмотрена в ТД, то сумму стоимости квартиры Вы можете учесть в составе расходов на оплату труда на основании п.25 ст. 255 НК РФ. Однако, эта сумма не должна превышать 20% от начисленной з/п сотрудников. (согласно ст. 131 ТК РФ, заработная плата, выплачиваемая в натуральной форме, не может превышать 20%).
Если оплата аренды жилья работником предусмотрена в ТД, то в этом случае на сумму арендной платы нужно начислять взносы в государственные внебюджетные фонды. Это прописано в ст.7 ФЗ от 24/07/2009 г. №212-ФЗ. Но тут обратите внимание на следующий момент: взносы нужно начислять только на те 20% арендной платы, которые учитываются в расходах при расчете налога на прибыль. Начисленные взносы уменьшают налоговую базу по налогу на прибыль, в составе расходов на оплату труда.
Если же найм жилья за счет работодателя ТД не предусмотрен, то учесть в расходах сумму арендной платы нельзя. Следовательно, и взносы во внебюджетные фонды в таком случае начислять не надо.
---
Например: сотруднику начислена зарплата в размере 10 тыс. рублей и при этом ему предоставлена комната в общежитии за 5 тыс. руб./мес. Организация оплачивает за работника стоимость проживания. В расходах организация вправе учесть только 20% от 10 тыс. руб., – т.е. 2 тыс. руб. Если же сотрудник оплачивает жилье сам, а затем эти затраты ему компенсируют, то сумму компенсации вообще нельзя учитывать в расходах. Такая позиция изложена в письмах Минфина России от 17 января 2011 года №03-04-06/6-1,17 марта 2009 года № 03-03-06/1/155, ФНС России от 12 января 2009 года №ВЕ-22-3/6.

Сложно понять первого, но раскажу про свою ситуацию: основную зарплату не трогали, а все расходы несла организация