Дочь выбирает специализацию коммерция или логистика, подскажите плюсы и минусы каждой?

Логистика лучше. Коммерсантов как собак нерезанных, любой торгаш на рынке готовый коммерц. А толковых логистов не очень много, даже есть нехватка.

Логистика более перспективна.

Как Логист могу сказать - эта вакансия подходит больше для мужчин, потому как приходится работать с водителями, а в некоторых фирмах на такую вакансию берут человека который еще и за ТО следить будет и за ГСМ отвечать. Если фирма солидная, то там все эти должности занимают разные люди, а в мелкой небогатой конторе для экономии вешают все на одного сотрудника. Девушке в мужском водительском кол-ве будет сложновато, НО! надо понимать, что Диспетчер и Логист с одной стороны одно и тоже, а во многом совершенно разные должности.
Коммерцию надо заканчивать на 5, чтобы пойти в солидную контору, но опять же всё зависит от фирмы. Девчонки по 5 лет в универе учатся, а потом приходят устраиваться спрашивают :"Последнюю версию 1С знаешь? " - нет, "До свидания мы вам перезвоним". От безысходности идут работать обычными торговыми представителями и т. д., хотя с таким дипломом даже там по карьерной лестнице легче идти.
Я точно не знаю, на кажется на таком факультете есть на 4-5 курсе узкие специализации - вот там и надо уже выбирать направление. А вообще на 3 даже курсе перевестись на заочное, и пойти тупо работать торговым (если есть авто), чтобы уже к выпуску иметь опыт и понимать с чем придётся работать.
Торговля и комерция дело о-о-о-о-очень тонкое, тут я категорически не соглашусь например с Tolik Panarin. Торгаш на рынке бывает по круче топ-менеджера из крупной корпорации подкован.
Торговля и уметь ПРОДАВАТЬ - это дар! Но ему тоже можно научиться, есть стандартные приёмы. В зависимости от уровня преподавателей и программы в универе можно неплохо подчерпнуть азов и знаний.