Пришло требование, пояснить расхождения по декл. НДС за 2 года нашли расхождения на 300тыс. Что делать ума не приложу?

Согласно статьи 88 НК РФ срок проведения камеральной проверки - 3 месяца со дня представления налоговой декларации.
По истечении указанного срока, если к налогоплательщику не возникало вопросов со стороны инспекции (не направлялись требования, уведомления о вызове и пр.), то налогоплательщик считает, что отчет успешно принят и прошел проверку без претензий.

Полученное вами требование незаконно, т. к. направлено вне рамок налоговой проверки (3-месячного срока). Я такие Требования обжалую в вышестоящий налоговый орган и получаю от инспекции решение об отмене Требования.

запомните одно-бухгалтер-это глубоко интимная тема.. и если он захочет может вас под статью подвести.. и здесь даже не вопрос оплаты ему а доверия.. я своему доверяю полностью..

Вы же сами сказали, что была у вас упрощенка и с ней работали вы с вычетом по НДС, что незаконно! Поэтому и выявилась недоплата НДС. Мда... Я вам не завидую Придется расчитываться за чужие ошибки.

Проверьте все платежки у себя с ОКТМО, возможно при перечислении бухгалтер допустил ошибку. Также провербте ОКТМО в декларациях. Это для начала.
А вот то что была упрощенка а работали по ОСН. Это проблема. Во всяком случае начисленный НДС могут принять, а вот к вычету весь убрать. И получиться что Вы будете должны.

Сверьте все платежи с налоговой .Может ваша переплата 284 тыс . ,у них висит на другом КБК или ОКТМО. На упрощенке ставить на возмещение НДС нельзя .Только платить .