№ 307-ФЗ "Об аудиторской деятельности".

Поскольку дата представления отчетности за 2008 год уже в 2009 году, соответственно, в состав представленной до 30 марта 2009 года отчетности должно входить аудиторской заключение по организациям, которые подлежат обязательному аудиту по условиям ФЗ №307-ФЗ.
Поэтому у вас попросили заключение.

В соответствии со статьей 26 данный документ вступает в силу с 1 января 2009 года, за исключением части 9 статьи 11, статьи 12 и 16, вступающих в силу с 1 января 2010 года и частей 1 - 8 статьи 11, вступающих в силу с 1 января 2011 года.

Статья 26. Вступление в силу настоящего Федерального закона

1. Настоящий Федеральный закон вступает в силу с 1 января 2009 года, за исключением частей 1 - 9 статьи 11, статей 12 и 16 настоящего Федерального закона.

2. Части 1 - 8 статьи 11 настоящего Федерального закона вступают в силу с 1 января 2011 года.

3. Часть 9 статьи 11, статьи 12 и 16 настоящего Федерального закона вступают в силу с 1 января 2010 года.

В соответствии со статьей 26 данный документ вступает в силу с 1 января 2009 года, за исключением части 9 статьи 11, статьи 12 и 16, вступающих в силу с 1 января 2010 года и частей 1 - 8 статьи 11, вступающих в силу с 1 января 2011 года.
Обратной силы закон не имеет.

Обязательный аудит вы проводите в 2009 году по деятельности, которую вели в 2008. Закон вступил в силу с 01 января и изменились критерии для проведения обязательног аудита (ст. 5)и вы попали как раз по результатам в эти рамки.