Что означает фраза "в срок не позднее чем через 2 дня со дня убытия"

Это вы о миграционном учёте иностранных граждан? Правила русского языка тут ни при чём. Начало и окончание сроков в вашем случае определяет ГК РФ (глава 11 ст. 191-194)

Глава 11. Исчисление сроков

Статья 190. Определение срока

Установленный законом, иными правовыми актами, сделкой или назначаемый судом срок определяется календарной датой или истечением периода времени, который исчисляется годами, месяцами, неделями, днями или часами.

Срок может определяться также указанием на событие, которое должно неизбежно наступить.

Статья 191. Начало срока, определенного периодом времени

Течение срока, определенного периодом времени, начинается на следующий день после календарной даты или наступления события, которыми определено его начало.

. .

Статья 193. Окончание срока в нерабочий день

Если последний день срока приходится на нерабочий день, днем окончания срока считается ближайший следующий за ним рабочий день.

Статья 194. Порядок совершения действий в последний день срока

1. Если срок установлен для совершения какого-либо действия, оно может быть выполнено до двадцати четырех часов последнего дня срока.

Однако если это действие должно быть совершено в организации, то срок истекает в тот час, когда в этой организации по установленным правилам прекращаются соответствующие операции.

2. Письменные заявления и извещения, сданные в организацию связи до двадцати четырех часов последнего дня срока, считаются сделанными в срок.

==Вот и считайте. Убыл иностранец 1-го числа, а 2-х дневный срок уведомления ФМС начинает исчисляться СО СЛЕДУЮЩЕГО ДНЯ (ст. 191 ГК) ,то есть со 2-го. Ваши два дня-это 2 и 3 число. 4-го числа уже будет поздно.
==Если 3 число- выходной день, то последний день срока соответственно переносится на ближайший рабочий день. (ст. 193 ГК)
всё очень просто.

Это обозначает, если вы убыли 25 числа, то 28 число будет считаться крайним

если сегодня вторник, то через два дня будет четверг.
отсюда и выводы