перерегистрация ООО...

http://www.garant.ru/pereregistr_2009/
Посмотрите тут.
Думаю, что запрета такого нет - можете подать все сразу

в журнале 1С пошаговая инструкция

Вроде уже был этот вопрос, но можно и повториться. "Перегистрация" ООО - это всего лишь условный (жаргонный) термин.
Документы в ИФНС надо преъявлять как для обычной гос регистрации изменения учредительных документов, т. е. по перечню в ст. 17 ФЗ "О гос. регистрации юр. лиц ...":
- заявление Р13001 (по форме, рекомендованной ФНС на своем сайте (www.nalog.ru.);
- решение ед. участника (или протокол собрания участников) о внесении изменений в Устав (или об утверждении Устава в новой редакции) ;
- изменения, вносимые в Устав (или Устав в новой редакции) ;
- документ об уплате государственной пошлины - 400 руб.
На счет совмещения – конечно, ничто не запрещает подать одновременно и форму Р13001 и форму Р14001. Но если документы для "перегистрации" еще не готовы, то откладывать подачу данных нового паспорта в ЕГРЮЛ опасно. Представлять форму Р14001 с данными нового паспорта ГД нужно не позднее 3 дней с даты его получения в срок, иначе можно получить штраф 5000 руб. (п. 5 ст. 5 ФЗ "о гос. регистрации юр. лиц и... " и п. 3 ст. 14.25 КоАП РФ) . Так что подумайте, стоит ли объединять эти действия.
Удачи.

-Устав ООО в новой редакции составить, привести в соответствие с Законом №312 от 30.12.2008..
-Госпошлина 400 р. (заполнить пл. поручение -реквизиты на cайте ФНС России)
-Протокол или Решение единственного участника об утверждении Устава в новой редакции
-Заявление по РЕКОМЕНДОВАННОЙ форме 13001 Достаточно этой формы. Заверяется подпись Заявителя- Руководителя у нотариуса
Смотри документы на сайте www.nalog.ru
ФНС РФ ,«Консультант» или могу выслать

почему нет. стандартный пакет документов - новый устав (либо изменения в устав) , протокол (решение) и форму 13001 и 14001, заверяете формы у нотариуса и вперед в ИФНС 46