Можно ли наложить арест на счет?

Арест накладывается не на счет, а на денежные средства на счету (ст. 91 АПК РФ) . В отношении второго счета вам необходимо будет представить доказательства что это их счет.
Кроме того, самым сложным при необходимости применения обеспечительных мер является доказать суду, что возникнут затруднения или невозможность исполнение суд. акта.
Статья 90 АПК РФ. Основания обеспечительных мер
1. Арбитражный суд по заявлению лица, участвующего в деле, а в случаях, предусмотренных настоящим Кодексом, и иного лица может принять срочные временные меры, направленные на обеспечение иска или имущественных интересов заявителя (обеспечительные меры) .
2. Обеспечительные меры допускаются на любой стадии арбитражного процесса, если непринятие этих мер может затруднить или сделать невозможным исполнение судебного акта, в том числе если исполнение судебного акта предполагается за пределами Российской Федерации, а также в целях предотвращения причинения значительного ущерба заявителю.
Советую ознакомиться со следующим документом Постановление Пленума ВАС РФ от 12.10.2006 N 55
"О применении арбитражными судами обеспечительных мер"

В заявлении ты можешь указать не только счет, указанный в договоре, но и все известные тебе счета, приложив к заявлению документы, подтвержающие наличие у ответчика наличие этих счетов, поскольку это не запрещено АПК.
Да, и когда будешь просить о применении обеспечительных мер, то проси наложить арест именно на денежные средства, а не на счет, так как счет, в отличие от денег не является имуществом организации.

Если сведения о счете официальные, то можно, так как в соответствии с п. 3 ст. 71 АПК РФ доказательство признается арбитражным судом достоверным, если в результате его проверки и исследования выясняется, что содержащиеся в нем сведения соответствуют действительности. Интересно, как вы будете в своем заявлении доказывать о действительности этого счета? А вообще-то, мне непонятно, зачем вам накладывать арест на счета? Ведь суды накладывают арест не на счета должника! в кредитных учреждениях, а на имеющиеся на счетах должника денежные средства! в пределах суммы имущественных требований. Ведь если суд удовлетворит ваше ходатайство о принятии обеспечительных мер, а должники во время пробега исполнительного листа из суда к приставам откроют еще счета, либо у них уже есть открытые счета, о которых вы не знаете, что делать тогда? А если судом будет вынесено определение содержания: "наложить арест на денежные средства ООО "Рога и копыта" в сумме 123456789 рублей.... ", в таком случае пристав будет проверять и накладывать арест на все установленные счета должника в пределах суммы требований. Ведь денежных средств даже на всех счетах может быть недостаточно, а вы хотите заявить всего только два.