ности матери и отчима была 3 комнатная квартира

Если падчерица отчима (родная дочь матери) на момент смерти матери была прописана (зарегистрирована) в этой квартире, то вместе с отчимом она фактически приняла наследство после умершей матери. Какую часть, сказать сложно, поскольку неизвестно, каким образом квартира перешла супругам в собственность: если по приватизации, то супружеской доли нет, значит по 1/4 отчим-падчерица. Если купля-продажа - там выделение супр. доли, значит, 1/4 сразу отчиму, а вторая четверть - пополам с падчерицей (по 1/8), итого 3/8 отчима и 1/8 дочери.
После смерти отчима наследует только его дочь (если падчерица не была удочерена отчимом) , то есть 1/2+доли, принятые им фактически, после смерти его жены. У нее получается либо 1/2 (2/4)+1/4=3/4, либо 1/2 (4/8)+3/8=7/8.
У нотариуса это можно пытаться оформить только в том случае, если сестры были зарегистрированы с родителями совместно. Если нет - только через суд, для которого, тем не менее, нужно получить отказ от нотариуса, который ведет наследственные дела умерших по этому району.

Сроки принятия наследства пропущены у всех

Скорее всего наследует одна только дочь отчима. Не понятно как квартира была в собственности, в долевой. приобретена в браке. приватизирована, был ли зарегистрирован брак между Вашей мамой и отчимом. Вопросов много.

а в кв кто-то из детей прописан?

дочь отчима еще может унаследовать квартиру, если по истичении 3-х лет никто не предъявил прав на наследство, тогда квартира считается вымороченным имуществом и отходит в пользу государства. Но если квартира, была приватизирована на всех членов семьи, и они все вместе проживали в ней, то доля переходит автоматически, но документы переделывать все равно придется.

зависит от того, кто вступил в права наследования в сроки. обе живете там. была ли регистрация брака у матери. большая доля у дочери отчима.

Наследует родная дочь отчима.