Женщина-один из трех учредителей ООО. Работала в нем бух-ом. Написала заявление о выходе. Дир-р подписал, составили

Скорее всего не внесены изменения в Единый государственный реестр юридических лиц (ЕГРЮЛ) о выходе из учредителей, надо подать документы установленным формам в налоговую. Центр занятости скорее всего ориентируется на этот реестр, потом можно взять выписку из ЕГРЮЛ об вашей ООО, где будут указаны учредители-физические лица.

Работа в должности бухгалтера и участие в ООО совершенно разные и невзаимосвязанные вещи. Право на выход участника из ООО определен ст. 26 ФЗ "Об ООО"
http://www.consultant.ru/popular/ooo/48_3.html#p594
Статья 26. Выход участника общества из общества
1. Участник общества вправе выйти из общества путем отчуждения доли обществу независимо от согласия других его участников или общества, если это предусмотрено уставом общества.
Право участника общества на выход из общества может быть предусмотрено уставом общества при его учреждении или при внесении изменений в его устав по решению общего собрания участников общества, принятому всеми участниками общества единогласно, если иное не предусмотрено федеральным законом.
2. Выход участников общества из общества, в результате которого в обществе не остается ни одного участника, а также выход единственного участника общества из общества не допускается.
4. Выход участника общества из общества не освобождает его от обязанности перед обществом по внесению вклада в имущество общества, возникшей до подачи заявления о выходе из общества.
Смотрите и 21 статью закона
http://www.consultant.ru/popular/ooo/48_3.html#p406

У неё должна была быть запись в трудовой книжке о том, что она работала бухом.
Должен быть приказ о расторжении с ней трудового договора. На основании этого приказа вносится запись в трудовую книжку.
Трудовая книжка, как документ строгой отчетности, является одним из документов, которые будут представлены в центре занятости.
Вообще, необходимо будет при себе иметь паспорт, пенсионное удостоверение, трудовую книжку, справку с места работы, заполнить справку по форме службы занятости.

Что составили?

Необходимо составить протокл учредителям о выходе участника из числа учредителей и написать в налог. инспекию от имени директора заявление о внесение изменений в ЕГРЮЛ