После смерти отца наследство получили дочь, сын (от первого брака) и вторая жена по 1/3 доли каждый. Через 3 месяца выяс

Опять автор вопроса не понимает что такое приватизация.. .
Почитайте в Википедии, прежде, чем задавать вопрос.
Неприватизированную квартиру невозможно наследовать.
Соответственно, и ответить на Ваш вопрос правильно невозможно.

нет, с какой стати? Квартира приватизирована отцом. Сын и дочь имели бы право на участие в приватизации, если бы были там вместе с отцом прописаны. Насколько я понимаю, он прописался один.
У вас все законно

отец стал собственником квартиры в результате приватизации, а не наследства
и какая разница для наследников как он стал собственником? что это меняет?

Нечего тут оспаривать. Квартиру наследуют дети и жена покойного. Каждому по 1/3 доле.

Квартира, в которую отец прописался до приватизации принадлежала государству, а не бабушке. Поэтому всё, что связано с бабушкой не имеет никакого значения. Отец - первый собственник квартиры, бабушка тут ни при чём.

Все правильно сделано, по закону, Ваша бабушка в свое время жила с сыном в квартире по найму, умерла, отец остался прописан и все права на квартиру получил только после приватизации, после смерти матери. Дочь, сын и жена наследники 1 очереди и поровну получили, это неоспоримо, не тратьте время зря

имеют полное право, если наследование по закону, а не по завещанию. Но даже если по завещанию, если они там не указаны, и если являются нетрудоспособными (несовершеннолетние, пенсионеры, инвалиды) , то также имеют обязательную долю