Куда девается память с диска D ?

открой эти папки и посмотри что в них там )))

Системная информация плюс битые сектора

я предполагаю, что диск D не физический, а логический раздел от общего диска (вместе с системным), а то действительно объем несколько странный

угадал ?

производители жёстких дисков указывают объём в миллионах и миллиардах байт:
1Gb = 1 000Mb = 1 000 000Kb = 1 000 000 000 bytes,
а в реальности же: 1Gb = 1024 Mb, 1Mb = 1024Kb, 1Kb = 1024 bytes, отсюда получаем:
Например, 160Gb, заявленные на наклейке ЖД = 160 000 000 000 bytes /1024/1024/1024 = 149Gb
Так и с остальными, посчитай для своего

есть временные файлы. .
возможно много мелких файлов:
файл занимает место, кратное размеру кластера вне зависимости от его размера.. .
т. е. , если кластер на жестком диске равен 32Кб, а файл занимает 100 байт, то на жёстком диске он будет занимать 32Кбайта.. .
можно такие мелкие файлы, если они не системные убрать в сжатую папку-Zip
и вообще можно на некоторых директориях с данными в свойствах поставить "разрешить сжимать"...

ccleaner в помощь.

390 - это вы когда создавали этот диск, вносили такое значение, или система пишет такой объем?

390??? Что-то на своем веку не припомню таких объемов.

Проверь на вирусы dr.web cureit
скачай с их оф. сайта

Скрытыми бывают и системные файлы и папки. Их просто так не увидешь. Открой тотал коммандер и смотри содержимое диска. Они (системные скрытые) отмечены восклицательным знаком. Смотри, включена ли опция показать скрытые и системные файлы во вкладке вид - расширенные настройки