Можно ли к разъёму SATA Express подключать обычные жёсткие диски и в чём разница?

Подключай. Все SATA обратносовместимы. Потери скорости не будет, так как запись\чтение стандартных винчестеров .7200 даже далеко до пропускной способности интерфейса SATA 1 не дотягивают.

SATA Express – интерфейс подключения жестких дисков и SSD накопителей к материнской плате. Поддерживает хост-идентификацию возможностей устройства. Программно совместим с SATA, но в качестве несущего интерфейса используется PCI Express. Конструктивно представляет собой два рядом расположенных в длину SATA порта и разъем PCI-E, что позволяет использовать как накопители с интерфейсом SATA, так и непосредственно накопители, изначально поддерживающие SATA Express.

Интерфейс SATA Express поддерживает как PCI Express-, так и SATA-устройства хранения данных, при этом используется несколько линий PCI Express и два порта SATA 6 GB/s, через тот же разъем SATA Express. Используемые линии PCI Express обеспечивают для подключения накопителей «чистый» PCI Express, без каких-либо дополнительных контроллеров. В качестве дополнительного преимущества выбор PCI Express позволяет использовать несколько линий PCI Express различных версий для увеличения полосы пропускания. Например, с помощью двух линий PCI Express 2.0 обеспечивается пропускная способность 1000 МБ/с, а при использовании двух линий PCI Express 3.0 она возрастает до 1969 МБ/с. Если же подключать накопители к SATA 6GB/s, максимальная пропускная способность не превышает 600 МБ/с.

Конечно можно, они обратносовместимы. Стандратному HDD хватает SATA-2 интерфейса, поэтому скорость работы не увеличится, но будет максимально возможной для жёсткого диска.

Можно, если материнка поддерживает. Например, на Gigbyte GA-B250-HD3P такой поддержки нет.