2. Гражданин РФ Сидоров во время пребывания на стажировке в Германии нанес тяжкое увечье немецкому гражданину

Конституция Российской Федерации
Статья 61
Гражданин Российской Федерации не может быть выслан за пределы Российской Федерации или выдан другому государству.

Согласно ст. 61 Конституции РФ и ст. 4, ч. 5, Федерального закона от 31 мая 2002 г. N 62-ФЗ "О гражданстве Российской Федерации" российский гражданин не может быть выслан за пределы Российской Федерации или выдан иностранному государству. Этот запрет учитывает и норма УК РФ (ч. 1 ст. 13), в соответствии с которой граждане Российской Федерации, совершившие преступление на территории иностранного государства, не подлежат выдаче этому государству. Невыдача российских граждан не означает освобождение их от уголовной ответственности за совершение преступлений на территориях иностранных государств. Правоохранительные органы России обязаны возбудить уголовное преследование против российских граждан, подозреваемых в совершении преступлений на территории других государств и вернувшихся на территорию Российской Федерации. За преступления, совершенные российским гражданином за границей, он подлежит уголовной ответственности по законам своей страны. В этом принципе выражается ответственность гражданина перед своим государством, необходимость обеспечения принятых в государстве гарантий защиты его прав и интересов в уголовном процессе.

Даже если бы и был заключен договор о правовой помощи, все равно бы не выдали.
Поэтому выдан не будет, но уголовной ответственности не избежит. Однако уголовное дело будет возбуждено в России в соответствии с российским законодательством - Уголовный кодекс РФ, Статья 111. "Умышленное причинение тяжкого вреда здоровью" или Статья 118. "Причинение тяжкого вреда здоровью по неосторожности".

Граждан России не выдают иностранному государству. Осужден он будет в России.

Россия не выдает своих граждан, а осужден будет по законам РФ, Учите материал.