Действие обоих препаратов направлено на улучшение процесса пищеварения с устранением дискомфорта. И Мезим, и Панкреатин устраняют тяжесть в желудке, тошноту при переедании или злоупотреблении жирной пищей. Можно считать, что одно лекарство — аналог другого. Однако эти средства не являются идентичными. Состав обоих медикаментов включает одинаковые ферменты. Основные отличия отечественного Панкреатина и зарубежного Мезима вызваны разницей в величине активности энзимов:
состав 1 таблетки Мезима включает свиной панкреатин с минимальной активностью энзимов липазы — ЕД ЕФ 3500, протеазы — ЕД ЕФ 250, амилазы — ЕД ЕФ 42 004;
в таблетках Панкреатина по 250 или 300 мг используется свободная дозировка с неизмеренной активностью энзимов.
Следовательно, ферментный препарат Панкреатин является средством улучшения функциональности пищеварительной системы, а Мезим считается его аналогом с точной цифрой по активности энзимов в составе 1 таблетки. Оба препарата отличаются по стоимости: Панкреатин дешевле Мезима.

Какой препарат лучше?
Сравнение двух лекарств позволит каждому определить, какой лучше:
В Мезиме применяются энзимы, полученные из тканей крупного рогатого скота, в Панкреатине — из свиного материала.
Мезим считается слабым препаратом, поэтому чаще применяется для облегчения несерьезных состояний переедания у взрослых и больше пригоден для назначения детям. Однако существует еще два вида таблеток: Форте, Форте 10 000 с повышенной активностью ферментов, следовательно, действие будет эффективнее. Форте 10 000 — качественный заменитель Панкреатина.
Панкреатин отличается высокой активностью, поэтому его следует назначать осторожно.
Оба лекарства противопоказаны при серьезных болезнях поджелудочной железы, печени, желчного пузыря.
Лечение Мезимом и Панкреатином назначается только при функциональной недостаточности ферментов.
Мезим можно принимать самостоятельно, а для лечения Панкреатином нужна консультация врача.
Приставка «форте» к обоим препаратам определяет повышенный уровень активности ферментов, поэтому средство будет несколько действеннее обычного Мезима и Панкреатина.
Мезим производится немецкими фармацевтами, а Панкреатин относится к отечественным продуктам.
При серьезных нарушениях работоспособности ЖКТ, острых и обостренных течениях заболеваний органов пищеварения рекомендуется заменить оба лекарства на более действенные аналоги, например, Креон, Панзинорм.
Оба средства относятся к категории профилактических медикаментов при общих расстройствах пищеварения, не усугубленных серьезными воспалительными процессами и прочими заболеваниями органов ЖКТ.
Несмотря на отличие в ферментной активности, в отдельных случаях Мезим может стать хорошей заменой Панкреатину и наоборот.

Подробно здесь:
http://pishchevarenie.ru/pancreas/lechenie/chto-luchshe-mezim-ili-pankreatin.html