Вчера заплатила налог через Сбербанк онлайн, но система все еще показывает задолженность? Возникла какая-то ошибка?

Нет, все в порядке.
Онлайн-платеж не означает, что списанные с Вашего счета деньги моментально достигли налоговой. Они только списались с Вашего счета быстро.
Проведя платеж-онлайн Вы только дали распоряжение банку произвести перечисление.
Один банковский день (как минимум) требуется Сбербанку на оформление платежного документа на передачу платежа в бюджет.
Еще как минимум один потребуется Управлению федерального казначейтсва по региону на зачисление платежа в бюджет и на отнесение его на определенный налог и определенный налоговый орган.
Еще через день документы поступят в саму инспекцию.
Как правило, платежи, оформленные онлайн, не содержат данных о плательщике - на них формируется специальный уникальный номер и только, расшифровка номера (Ваши ФИО и ИНН) идут отдельным реестром. Таковы особенности банковских электронных платежных операций.
То есть платежу мало дойти до инспекции, нужно чтобы туда еще и дошла отдельная информация о Вас: в инспекции она соединится в одно целое и ляжет в Вашу карточку. Только после этого Вы платеж увидите в своем Личном кабинете.

Весь путь занимает 2-4 банковских, т. е. рабочих, дня.
Путь Вашей платежки начался только сегодня - вчера был нерабочий день.
Так что в ЛК Вы платеж увидите в лучшем случае 5 мая.

банковские платежи идут три дня

Какая ошибка?
Вчера, вообще-то был нерабочий праздничный день, как в банке, так и в ФНС.

Обработка в налоговой идет до 2-х недель

у меня так один раз неделю висела ( щас плачу только через МБО