Подскажите каким образом можно изменить доли собственников жилья?

Если между сособственниками уже имеется устное соглашение, то его надо заверить в нотариальной конторе, на основании чего в дальнейшем нужно обратиться в БТИ и т. д.

Только через суд.

Только в суд, для выделения доли.

Никаких судов вы можете составить соглашение сторон об определении долей у любого юриста Например определить как 1/2 у одного и по и 1/4 у двоих (если конечно все стороны согласны) погасить в ФРС старые свидетельства и получить новые с новыми долями позже продать 1/2 это как раз будет одна комната Правда тот кто продаст 1/2 повиснет без жилья но если по честноку двое кто остался с 1/4 долями могут подарить ему по доле что бы в итоге у всех троих получилась треть от оставшейся части то есть по 2/6 у каждого из троих

Если это квартира, то не важно у кого сколько долей, вы можете определить порядок пользования квартирой сделав это виде соглашения и заверить у нотариуса. Но это не означает, что выделили по этому соглашению долю в квартире. Доли в квартире в натуре не выделяются как в частном доме, где можно в свою половину сделать отдельный вход. Нет. Еще раз повторяю только определят порядок пользования. Этот порядок в последствии можно и продать.

Оформить право собственности на отдельную комнату можно только в коммунальной квартире. В обыкновенной можно перераспределить доли. Но это все равно будет часть квартиры а не отдельная комната. Вы можете определить порядок пользования (кому какая комната) . Но распродать по комнатам квартиру не получится.