В чем заключается сложность понимания как работает мозг?

Самому в собственные мозги влезть и подрихтовывать как нужно на подобие часов нам никому не дозволено

Да самые элементарные вещи мне непонятны.
Я могу объяснить как работает автомат. Я могу, используя понятие рефлекса, объяснить как организм реагирует на возбуждение.
Но что такое сознание? Как активность отдельных нейронов приводит к тому, что я вижу цельную картину и осознаю свои мысли. Где это Я и как оно связано с клетками мозга?

Подробно всё объяснит проф. С. В. Савельев на Ютьюбе своими лекциями и выступлениями — он как раз по этой части со всеми званиями и научными степенями. Другое дело, что до его понимания мозга многие ещё не доросли и с ними пока нет ещё контакта.

В самом процессе его работы который зависит от массы биохимических и биофизических факторов, не подающихся учету. Если даже гипотетически скопировать и оцифровать состояние мозга на данный момент каким-то образом, то это будет лишь копия состояния, не способная к работе т. е. не личность. Если бы удалось эмулировать весь комплекс процессов, то опять-таки оргинальная личность получена не будет, а будет в лучшем случае лишь личность, запрограммированная в эмуляторе на момент программирования самих процессов. Мозг это прежде всего мыслительные процессы, а не просто физическое состояние органа.

Здесь об этом много интересной информации — https://thequestion.ru/questions/210171/answer-anchor/answer/311995?utm_source=yandex&utm_medium=wizard#answer311995-anchor

в том, что никому не понятно, как он работает

в отсутствии мозга