Имеет ли право пассажир верхнего бокового места в плацкартном вагоне занимать нижнее сидение во время бодрствования?

Проводника спрашивайте. Он - хозяин в вагоне.

вот пусть они и сидят в других отсеках.

сядь в другом отсеке, в чем проблема?

Нет, не имеет. Обычно соседи договариваются, но если "он потребовал", значит договариваться не хочет и пусть идёт лесом.

Я купил нижнее место, а вы купили верхнее. Я не разрешаю вам ехать на мною купленном месте. А своему родственнику разрешаю. По моему, логично.

В правилах проезда сказано, что пассажиры на время поездки обязаны занять место, которое указано в билете.
Иначе говоря, по закону каждый пассажир получает билет на определённое место, которое он имеет право занять и использовать по своему усмотрению: спать, лежать, есть, читать, … На период поездки каждый пассажир - хозяин своего места. И только Он распоряжаетесь им, как захочет. И если пассажир с нижней полки захочет, как радушный хозяин, пустить на свою полочку пассажиров сверху – он пускает, но если не захочет – это его право. Он заплатил за своё место.
Хотела бы ещё напомнить, что места на верхние полки стоят в 2 раза дешевле, чем места на нижние. Получается, что нижние пассажиры получили комфорт, а верхние – экономию. Каждому – своя выгода.
То же самое касается багажа. Нижний ящик для багажа занимают вещи пассажира снизу. Для пассажиров сверху предусмотрена верхняя полка. Так что права никакого не имеет претендовать на чужие полки.

Если не конфликтовать, то можно и договориться. Понятно, что это неудобно, но пешком тоже не пойдёшь, а купе стоит в разы дороже.