отрезали на орхидее цветонос до самого конца

Зачем отрезали? Фаленопсис? И не должен он расти в воде.
Если на орхе, то вырастет новый в воде тоже держать нельзя.

Я всегда отрезаю отцветший цветонос почти до самого основания. Как-то ради эксперимента оставила часть цветоноса, в результате получила метровую палку с парой цветочков. Новые цветоносы образуются под третьим-четвертым листом, новые листья растут, значит и цветение будет, если, конечно, тепла и света хватает

Ничего не понятно... Дайте фото что ли.
Без фото можно только предположить. Почки, скорее всего зачатки корней или цветоносов. В воде её держать нельзя. Орхи не любят повышенной влажности.
Об орхидеях почитайте здесь http://www.orchidee.ws/ большинство вопросов отпадут.

Вообще ничего не поняла... Если Вы отрезали цветонос до конца - то ничего уже не вырастит из него. И почему у вас орха растет в воде?

Просто надо ждать. Поливать растение специальным удобрением. А почки могут оказаться новыми воздушными корнями. А я теперь не отрезаю даже засохшие цветоносы. Я их использую как опору для живого цветоноса.

Нужно фото посмотреть, по описанию не совсем понятно что у вас произошло...

эти почки меж листьев и есть новый растущий цветонос

В любом случае, если что-то растет, это уже хорошо!
http://domfloris.ru/komnatnie-rasteniya/kak-pravilno-uhazhivat-za-orhideey.html
Цветонос у орхидеи растет строго из стволика (направлен строго вверх, имеет остренький кончик, похожий на клювик), где проходит центральная жилка листа. Корень растет из любого места в стволике (чаще направлен вниз), даже из центра, где проходит центральная жилка листа. Кончик корня зеленый, округлый, неподалеку виден светлый веломен.