Корневая шейка на фото в близком обзоре - вполне нормальная.
Если увядает один нижний лист - не страшно.
Если и есть проблема, то она внизу горшка.
На дне есть сливные отверстия?
Лучше использовать прозрачные горшки, причём к уже имеющимся отверстиям на дне желательно дополнительно сделать их по стенкам горшка (дрелью получаются достаточно аккуратными - см. фото).
То, что шейка открыта - хорошо, в жару можно прикрывать верхние корни мхом сфагнумом, НО важно: разложить её надо по диаметру, оставляя открытой корневую шейку (это самое уязвимое место при переувлажнении).
Я бы пересадила, используя только кору + небольшие куски пенопласта или пробок. Нет ли проблемы в основании стебля? - это внизу между корнями.
К этому месту желательно подложить кусок пенопласта - для гарантированной вентиляции (см. картинку правильной посадки - в комментарии)
У фаленопсиса отсыхающие листья резать НЕ надо - сами отвалятся, когда отдадут всё, что есть полезного.

В этих кашпо есть "пенёк", который приподнимает внутренний горшок: при сливе излишков воды корни не намокают.