Какой язык учить первым? Java или JavaScript? В чем разница?

В чем отличие JavaScript от Java?
Язык программирования JavaScript, разработанный в компании Netscape, Inc., не входит в состав платформы Java.

JavaScript не применяется для создания апплетов или автономных приложений. Чаще всего JavaScript находится внутри документов HTML и обеспечивает уровень взаимодействия с веб-страницами, которого невозможно достичь с помощью простых документов HTML.

Основные различия Java и JavaScript:
Java представляет собой объектно-ориентированный язык программирования, а JavaScript - это объектно-ор иентированный язык создания сценариев.
Java используется для создания приложений, которые запускаются на виртуальных машинах или в браузерах, а код JavaScript выполняется только в браузере.
Код Java необходимо скомпилировать, а код JavaScript используется в текстовом виде. Для них требуются различные подключаемые модули.

Чисто практически: JavaScript -- это текст, который выполняется в любом браузере без каких-либо дополнительных действий со стороны пользователя. Для выполнения байт-кода Java пользователь должен взять на себя геморрой по установке в системе виртуальной машины (VM) Java, что не всегда приемлемо (например, в корпоративной среде) . С другой стороны, на Java можно писать программы, которые совершенно без переделок будут работать в любой платформе, где есть эта самая Java VM.

Это абсолютно разные вещи. Что тебе больше нужно - то и учи.

Разница, как между барабаном и барабанной перепонкой.
Java - для приложений Android и Linux.
JavaScript - для сайтов.