Как правильно оформить приказ о наказании?

Акт сначала составить необходимо об отсутствии на рабочем месте. И принять с него объяснение. Может у него есть уважительная причина. А Вы его сразу наказывать. Может он по повестке в суд ходил и просто Вас не уведомил. После этого уже приказ. Форма свободная, устанавливается в каждой организации своя.

1)для взыскания должны быть законные основания
2)если есть документ, который определяет возможность взыскания за опоздание на работу (по закону это - Правила внутреннего трудового распорядка, ст. 189-190 ТК РФ) , то в этом документе должно быть чётко указано, какое взыскание за какое нарушение, например: опоздание до 1 часа - замечание, опоздание от 1 часа до 4 часов - выговор, опоздание более чем на 4 часа - увольнение и т. п.
3)если такой документ есть, то всё нормально. сотрудник пишет или не пишет объяснительную, и вы его наказываете: на основании ст__ Правил внутреннего трудового распорядка
4)если правил нет, то первое за 1 год нарушение - только минимальное, т. е. замечание. если это уже не первое за этот год нарушение, тогда - выговор, а если уже есть в течение 1 года выговор, тогда - увольнение (п. 5 ч. 1 ст. 81 ТК РФ)
5)только так будет по закону
6)а приказ пишется просто. 1 июня работник Иванов опоздал на работу на 7 минут без уважительных причин. это является нарушением трудовой дисциплины, согласно п. __ Правил внутреннего трудового распорядка. Приказываю: объявить Иванову замечание, согласно п. __ Правил внутреннего трудового распорядка. (если Правил ВТР нету, тогда пишется: согласно ст. 192 ТК РФ)

Приказ делается в свободной форме, естественно с наименованием организации, датой, номером, основанием.
Прогул - это отсутствие работника на рабочем месте без уважительной причины более 4-х часов подряд ст. 81 п. 6 пп. а) так что у вашего работника не прогул, а опоздание.
ст. 192, 193 ТК РФ
Выговор за то, что он шёл от проходной, до своего рабочего места 7 минут это слишком. Считаю, что можно ограничиться замечанием, а т. к. проходную он всё таки прошёл в 8.00 то тут вообще вопрос о применении дисциплинарного взыскания - спорный...

193 статью ТК посмотрите, там всё подробно описано. -это раз;
в трудовой договоре конкретизировано рабочее место? -нет? -тогда нельзя наложить дисциплинарное наказание-это два.

Нет. Наказать можно за прогул. А прогулом считается отсутствие без уважительных причин на рабочем месте в рабочее время в течение 15 минут. Тем более проходная уже считается местом работы. Если он не дурак, то сказку расскажет. А так необходимо отобрать у него объяснение о причинах отсутствия, т. е. провести служебное расследование. Без этого любой приказ о наказании суд или прокурор признают незаконным.