Помогите пожалуйста, в стихотворении Есенина "Анна Снегина" есть что-то непонятное.

1) Вы правильно понимаете.
Но на "на свободе " лучше воспринимать как "не в тюрьме"," не в заключении. "
То есть преступники гуляют на свободе, а не сидят в тюрьме .

2)Ну данном случае тысячи - это просто много . Тысячи в данном контексте не просто числительное обозначающие несколько 1000, а в значение большого количества .

3)Шишка ( когда слово используют для человека ) - это влиятельный человек, со связями в обществе, чиновник высокого ранга .
Но тут "известная шишка" - это просто известный человек, ну представьте себе участника k pop группы, он разве аналогичен чиновнику? нет
ну вот тут примерно тот же смысл .

4)Зеленя - это всё таки всходы злаковых культур, а не просто трава .
а так да, Вы правильно понимаете

Таких теперь тысячи стало, творить на свободе гнусь - сейчас полно всяких гадов, которые творят беспредел.

Ну да "Известная шишка" это важный человек, но в ироническом смысле.

Тростью сшибал зеленя - тростью бил траву )) Точнее, молодые всходы хлебов.

Совершенно согласен с предыдущими ответами. Даю лишь небольшие уточнения для лучшего понимания:
1.Войну объявили в 1914, разговор происходит в 1917, значит, войну объявили три года назад, "в третьевом" году. Третьевый - устаревшая, форма, просторечие.
В 1914 быт и отношения были более или менее устоявшиеся, нормы поведения людьми соблюдались. Поэтому убийство старшины на общем сходе всеми было воспринято как чрезвычайное событие. Но три года войны и революция сильно испортили общественные нравы, то, что воспринималось как преступление, стало обыденностью. Грешить, преступать мораль - "творить гнусь", причем, не таясь, а открыто - "на свободе", стало делом обычным. И творят это уже не отчаянные единицы, явление стало массовым - "теперь таких тысячи стало".
2.Слово "шишка" применительно к человеку имеет иронический оттенок. Так говорят не просто о высокопоставленном и влиятельном человеке, но о таком, который важничает. Первоначально говорили "шишка на ровном месте", потом выражение укоротили. Говоря о человеке, что он "шишка" или "важная шишка" могут подразумевать как то, что он, действительно влиятелен и занимает серьезный пост, так и то, что он возомнил о себе, заважничал, в общем-то, не имея на это серьезного повода (поэтому шишка - "на ровном месте"). В данном случае, на мой взгляд, имеет место второй смысл. Известный поэт - не влиятельный сановник, но он поднят над общим уровнем общественным мнением, он заважничал и "без просьбы уж к нам не придет".
3."Тростью сшибал зеленя" - в данном контексте значит, что герой, идя через молодые (зеленые) посевы злаков, с размаху срубал тростью колоски. Не знаю, как в других странах, а в России у многих людей есть такая привычка. Такое можно встретить часто и в стихах, и в прозе:

Сшибая саблей вялые ромашки,
Ведя с собой коня на поводу,
Без ментика, в расстёгнутой рубашке
Под ярким солнцем вниз к реке иду.
(Алексей Вронский).