Могут ли глаза быть пытливыми? "Степанида взглянула на них пытливыми глазами и чего-то там еще..."?

Очень даже можно. Читаем у классиков':
"Лаврецкий холодно слушал разглагольствования Паншина: не нравился ему этот красивый, умный и непринужденно изящный человек, с своей светлой улыбкой, вежливым голосом и пытливыми глазами."
Тургенев И. С., Дворянское гнездо, 1858
***

"А она, не сводя с него испуганных, пытливых глаз, водила сжатым кулаком себя по бедру и искала кармана"
Чехов" Тина" 1884 г.

Принято считать, что пытливым бывает ВЗОР или ВЗГЛЯД. А глаза бывают красивыми, большими, маленькими, близко или широко поставленными и так далее.

У плохого писателя ничего не может быть, а у хорошего может быть все

пытливым может быть взгляд, но никак не глаза:
Она пытливо посмотрела на него.

"тревожными" было бы лучше, или "выразительными".
"Пытливые" глаза у тех, кто что-то про вас знает, или догадывается, но молчит, и своим взглядом даёт вам это понять.

Пытливые глаза - это стилистическая тавтология. Автор приписывает качество объекту вместо действия. В художественной литературе мгновенно выявляет графомана. В поэтике стихотворений фраза вполне допустима, но показывает бедность образа. Как цитата, реплика в диалоге вполне применима, когда автор демонстрирует малограмотность персонажа или героя. Это шаблон, многократно применённая в произведениях фраза. Используется для упрощения произведения, придания разговорного оттенка тогда, когда необходимо задать окраску характера персонажа.

Можно вспомнить Г. Дж.. Уэлса:

– Нет, – произнес он в ответ настойчивому вопросу моих глаз, – я не член клуба, я – призрак.
– Хорошо, но это не дает вам права расхаживать по клубу.

теоретически да но в литературном плане звучит не красиво. глаза не бывают пытливыми есть пытливый взгляд.
глаза это орган.
перефразируй полностью.