Офицер приезжает из отпуска в день, когда должен явиться на службу. Ему пытаются инкреминировать

Это где они это прочитали? В какой статье приказа №....это сказано? Вы не обязаны доказывать свою невиновность. Они обязаны доказать ваше нарушение. У вас в отпускном сказано, что вы должны выйти на службу ...числа. Вы и вышли. Где написано, что вы должны прибыть по окончании отпуска к НАЧАЛУ рабочего дня? Что вы нарушили? В прямой постановке, а не в вольной интерпретации вашего начфина и стоевика. Нет такого.
Короче, пусть издают приказ по части о вычете деньег за ВПД, но деньги не отдавайте. Подавайте сразу в суд. А копия приказа по части - как раз и есть основание для подачи в суд на неправомерные действия командира части. Сохраните хотя бы копию отпускного и билетов.

Кроме опоздания на службу вам больше ничего предъявить не могут. А это всего лишь максимум дисциплинарное взыскание. Думаю ваше командование не настолько глупое, что бы еще что то предъявлять, а тем более то, о чем Вы написали.

отпуск... дней+ дорога-укладываетесь?

да, все должно быть в срок ( в рамках отпуска) . они правы

Ничего доказывать не надо. Если действительно решать удержать, то должны сначала провести разбирательство, издать приказ. Его и надо обжаловать. В суде командир обязан будет доказывать свою правота, а зая вителю надо доказать только факт удержания.

действия командования не правомерны. военослужащий может быть наказан только в дисциплинарном порядке-за опоздание. к тому же проездные использованы законно и по назначению.