Кто придумал частоты нот?

Почитай любую энциклопедию - музыкальную, большую советскую и т. д. Везде найдешь длинную статью, рассказывающую, когда, через какие труды и приключения и силами каких людей складывалась современная звуковая система. Один из ее ранних основоположников - Пифагор. Платон и Демосфен тоже принимали активное участие. Также сильно влияли перемены моды, политические перемены в мире, технические возможности инструментов, мифология. Иногда, как ни странно, сказывались и принудительные нововведения "приказным порядком". Разработка системы продолжалась даже в 20-м веке усилиями композиторов-додекафонистов и электронщиков. Стандарт эталона частоты менялся несколько раз, в-основном под влиянием вокалистов и духовиков. История длинная, запутанная и захватывающая.

Темперация - это на самом деле вовсе не "физика". Темперация находится с физикой в очень натянутых отношениях, и является не столько воплощением математической закономерности, сколько уступкой, компромиссом между симметрией и логарифмической иррациональностью. Пифагор на этой теме всю голову сломал в свое время, полжизни положил, чтобы этот компромисс выработать. В темперации Пифагором заложена точно рассчитанная погрешность, о которой хорошо знают все настройщики, и без знания которой просто не удастся настроить инструмент действительно "равномерно", т. к. если при настройке следовать чисто математической прогрессии, то квинтовый круг не сойдется, хоть тресни.. .

Короче, почитай, тебе понравится :-)

Считается что именно эти частоты наиболее благозвучны для слуха

Ес, от балды. Но есть темперированный строй, это то, как частоты гармонируют между собой.
Тут даже люди не при чем - это просто физика. ЛЯ можно хоть 1000 гц сделать - соотношение частот не изменится.