Какова структура атома

О квантовых объектах нельзя говорить, что она как-то расставлены, они не локализуются в пространстве. Это не шарики.

Оно не расставлено, а просто сосуществует, "занимая" какой-то объем. Это значит, что направляя в тот объем какой-либо объект (например, другую элементарную частицу или ядро, или атом) есть вероятность наблюдать не свободный пролет объекта, а его взаимодействие с "объемом, занимаемым атомом". И лишь очень грубо можно сказать, что в этом объеме расположены перечисленные частицы. Вообще, говоря о структуре субатомных объектов, используют такое понятие, как формфактор. Это аналог привычного "состоит из", точнее "имеет какую-то внутреннюю структуру". Но аналогия лишь приближенная!

Да, можно проводить какие-то наглядные аналогии, представляя электроны в атоме облаком "размазанного по пространству" заряда определенной конфигурации, ядро - как плотное образование в центре. А вот с составляющими ядра - протонами и нейтронами - все сложнее. Эксперименты показывают, что они не являются точечными частицами и не имеют равномерного сферического распределения плотности материи, а состоят из "чего-то", имеют внутреннюю структуру. Но эксперименты в разных условиях показывают разный "состав" (грубо говоря) . Дело в том, что конституентные кварки, из которых "состоят" нуклоны, окутаны плотной "шубой" виртуальных частиц, которые коренным образом меняют свойства кварков. И что мы "увидим внутри нуклона", сильно зависит от того, как мы исследуем их структуру.

P.S. Вообще-то все субатомные частицы принято называть элементарными (независимо от внутренней структуры).