Соединение атомов в молекуле

Палочки существуют. А то как же связь реализуется, не трением же между шариками -№)

Не всё так примитивно, но да, между ними есть зазор, опять же есть такое понятие как "длина связи". Вода например, охлаждаясь, расширяется именно из-за "объёмной" кристаллической решётки льда с множеством пустот.

В твердых и жидких телах частицы (молекулы, атомы, ионы) упакованы настолько плотно, что промежутков нет. Наоборот, они частично перекрываются (втиснуты одна в другую). Отсюда очень плохая сжимаемость жидкостей и твердых тел.

Это модель. Их несколько видов. На самом деле что-то среднее)

Вешество в привычном для нас виде состоит в основном из пустоты. Представьте олимпийский стадион, в самом центре лежит горошина, а по периметру стадиона по беговым дорожкам по круговой орбите летает пылинка. Так горошина - это ядро атома, а пылинка - электрон. Весь остальной стадион - пустота. Между атомами тоже такая же картина. И связь между атомами в основном благодаря электронам, так как они имеют привычку перескакивать с одного ядра на другой.
Кстати, если убрать пустоту из вещества и свалить все элементарные частицы в одну кучу плотно, наша с Вами планета Земля будет иметь размер баскетбольного мяча.

Нет, палочек нет. В реальности всё гораздо сложнее. Это химическая связь схематически показывается палочкой. На деле эта связь образуется при недостатке или переизбытке электронов. Разноимённые заряды притягиваются и частица с избытком электронов отдаёт этот избыток на электронную орбиту частицы с недостатком, ибо у частицы с недостаком есть свободный энергетический уровень. Эти частицы с электронными облаками представить довольно сложно, поэтому делают шаро-стержневые модели.