откуда взялись те впадины или углубления где океаны, моря, реки, озера?

Планета не может быть идеально ровной. Вообще, в мире нет ничего идеального. Поэтому всегда будут впадины, в которых располагаются озёра и моря.

Русла рек, помимо использования естественных впадин, промыты/пробиты потоками воды.

Океаны - это выходы тяжёлых плотных пород, поднимающихся из недр планеты. Поэтому они темнее материков, а уровень их равновесного положения - ниже (хорошо видно на поверхности Луны)

)

Разломы в коре земной ибо плиты разошлись или же под друга лягли

Дело не в углублениях, а в количестве воды. Если бы в океанах было гораздо больше воды, то водоемы были бы и на равнинах, и на вершинах гор, а не только в углублениях.

Если бы на Земле не было воды, то не было бы такой разницы между «выше уровня моря» и «ниже уровня моря». Земля просто была бы гигантским камнем с неравномерной поверхностью, как Луна, Марс и т. д.

На расстояние земной поверхности от центра Земли влияют: притяжение Земли (если б оно было слабее, то вершины гор были бы выше, потому что их не тянуло бы так сильно вниз), плотность и вес горных пород (горы выше такой-то высоты не могут быть, потому что они сжимаются под собственным весом, и их подножие начинает плавиться / рушиться от перенагрузки), притяжение Солнца и Луны (приливы могут менять формы рельефа (подтачивать и размывать вершины гор и т. д.) и забрызгивать воду туда, где раньше водоемов не было), подземные процессы (землетрясения, вулканы, движение плит, магнитное поле и т. д.), прочие факторы (уничтожение гор ветрами, взрывами природных газов, подземными водами, реками, вышедшими из берегов, эксплуатация природы людьми: шахты, карьеры и т. д.).

На расстояние воды от земной поверхности влияет давление воды (если где-то вода находится на такой-то высоте, то и в других местах она старается оказаться на такой же высоте), притяжение Земли / плотность атмосферы (выше определенной высоты воды в жидком виде находиться не может, потому что из-за слабого притяжения Земли там находится слишком мало атомов и они не могут сгруппироваться в воду и продолжают быть паром).