город который когда-то назвали сталицей сибири

Тобольск.

Томск .

Омск. Резиденция Колчака.

Новосибирск.
однако с точки зрения географии сибирский центр находится тясячах в двух километров от Новосибирска, как раз рядом с Красноярском и Иркутском. Так что если брать этот параметр для определения местоположения возможной столицы, то эти города - первые претенденты.
Если же рассматривать историческую составляющую, то Новониколаевск (бывшее наименование Новосибирска) , основанный лишь в 1893 году, вообще не вариант: есть населенные пункты и постарше, и посолиднее; некоторые уже в свое время являлись разного рода столицами.
Тюмень. Первый русский город в Сибири. Построен в 1586 году по приказу царя Федора Ивановича. Причем построен либо на месте, либо недалеко от столицы Тюменского ханства Чинги-Тура.
Тобольск. Второй русский город в Сибири. С самого основания в 1587 году считался столицей Сибири, центром ее русской коллонизации. Вплоть до 18 века на некоторых картах отмечался как "город Сибирь". С 1708 года - столица Сибирской губернии, а с 1764 года - Сибирского царства, в котором даже чеканили свою монету с гербом Сибири.
Томск. Он моложе вышеупомянутых городов - "лишь" в 1604 году по указу Бориса Годунова основан. Однако и его история дает ему возможность претендовать на столичный статус. Ведь образованная в 1804 огромная Томская губерния включала в себя территории нынешних Республики Алтай, Алтайского края, Кемеровской, Новосибирской и Томской областей, Восточно-Казахстанской области (Казахстан) и часть Красноярского края.
Омск основан еще позже - в 1716 году. Но и он успел примерить на себе "столичные погоны". С июля по октябрь 1918 года город считался столицей самопровозглашенной Сибирской республики. Затем он стал резиденций Временного Всероссийского правительства, а позже - Верховного Правителя России А. Колчака. Таким образом, во время Гражданской войны Омск являлся столицей Белой России, и даже неофициально именовался "Третьей столицей".
Указанные города (или населенные пункты, бывшие на их месте) ОФИЦИАЛЬНО назывались столицами. А ведь есть еще другие древние города - Чита, Барнаул, Бийск.. . -которые тоже непрочь получить "столичный статус".

Да, согласен. Когда-то Тобольск

Сейчас Новосибирск! А раньше все пути проходили через Томск и он считался центром!

Новосибирск