Ученые предполагают, что город заселяли дважды. В 400 году до н. э. – мирными индейцами, которые занимались сельхозработами. Именно они развили систему водных каналов для дождевой воды, которая сбегала к полям. К 150 году н. э. город был оставлен, возможно, из-за конфликта с соседними племенами. Спустя половину тысячелетия город заселили новые индейцы, построившие пирамиды, которые можно видеть сегодня. Новые жители возродили город, сделав его главным торговым центром юга полуострова Ютакан.
Большинство городов этого периода похожи друг на друга. Эцна имеет на своей территории широкое зеленое поле, за пределами которого в тени густых, но все же проходимых зарослей, находятся различные постаменты. Одной из самых заметных построек является главный храм, расположенный на 40-метровой платформе. Слева от храма виден высокий холм с колоннами, а справа находится ступенчатая платформа, похожая на пирамиду, растянутую вдоль горизонта. Ее называют Большим Домом. Возможно, она служила смотровой площадкой для наблюдения за ритуалами.
Еще одно необычное строение – небольшая пирамида, которая вместо ступеней имеет длинную наклонную дорогу. Рядом с ней находится небольшая площадка для игры в мяч. Она носила развлекательный характер, но отбирала жизнь двух игроков проигравшей команды – капитана и еще одного, их отдавали в жертву.
Большой Акрополь – огромная площадка, огороженная от поля стеной, а по бокам – двумя пирамидами. Главное здесь – пятиуровневое строение, высотой 35 метров. На каждом уровне есть маленькие помещения-кельи. Свет в них попадает только во время заката.
