С помощью какой программы форматировать диски с файловой системой нтфс при переустановке виндоуса? Partition Magic можно?

можно

можно и самой виндой там есть варианты форматирования после выбора на какой диск устанавливать.

1.Загрузитесь с установочного CD. Выберите пункт Восстановление системы, откроется Консоль восстановления. Войдите в существующую копию Windows и теперь можете делать что угодно. Например, отформатировать диск С при помощи команды format - легко, ведь консоль-то запустилась с CD. Или запустить diskpart и удалить все разделы.

Как воти в существующую копию Windows:

Для этого нужно в BIOS установить загрузку с CD-ROM'а, поместить в лоток CD-ROM' загрузочный диск с установочным пакетом Windows XP Professional и перезагрузиться. Когда установщик Windows XP загрузит свои файлы в оперативную память ПК, появится диалоговое окно "Установка Windows XP Professional", содержащее меню выбора, из которого нас интересует пункт "*Чтобы восстановить Windows XP с помощью консоли восстановления, нажмите [R=Восстановить] ".
Нажмите R. Загрузится консоль восстановления. Если на компьютере установлена одна операционная система, и она (по умолчанию) установлена на диске C:, то появится следующее сообщение:
1: C: \WINDOWS
В какую копию Windows следует выполнить вход?

Введите 1, нажмите Enter

Появится сообщение:
Введите пароль администратора:

Введите пароль, нажмите Enter (если пароля нет, просто нажмите Enter).

Появится приглашение системы:
C: \WINDOWS>

Введите format с: или format с: /Q /FS:NTFS где Q-быстрое форматирование->FS-файловая система.

Нажмите Enter

И введите y (что означает 'yes').

2.Если такой вариант не подходит, то можно отформатировать на другом компьютере, джампер ставим (SLAVE), там он отобразиться под другой буквой, как флешка, жмём правой лапой, выбираем форматировать.

3. Вариант, скачиваем файл образа диска ERD comander, прожигаем (опция прожечь образ), на болванку, получаем загрузочный востановочный диск, загружаемся с него, как в первом случае, в BIOS ставим загрузку с CD-ROM, после загрузки, находим раздел работа с дисками, форматируем.
Скачать: http://ifolder.ru/6143559
ERD comander для Висты:
Скачать: http://hi-mediasoft.ru/2009/01/26/microsoft-erd-commander-v.6-2008-iso-obraz.html

4.Наконец форматирование с установкой:
Входим в BIOS/ Ставим загрузку с CD-ROM/ Ставим установочный диск XP/Удаляем старые разделы/Создаём новые/Назначаем активный раздел/Устанавливаем в этот раздел XP с форматированием.

Или:
Hiren's BootCD 9.8 RU
Мультизагрузочный диск с программами, необходимыми для работы с компьютером при сбоях и отказах операционной системы.
Включает в себя практически все, что нужно - утилиты для работы с жестким диском, его восстановления и диагностики, программы для работы с диском: форматирование, разделение, ремонт, тестирование и пр. , клонирование системы, утилиты диагностики всех узлов компьютера, файловые менеджеры, утилиты для работы в сети, антивирусы и многое другое.
Скачать: http://soft.softodrom.ru/ap/p6916.shtml

EASEUS Partition Manager Home Edition 3.0.2 - Программа для работы с разделами жесткого диска.
EASEUS Partition Manager позволяет легко и безопасно выполнять любые операции с разделами жесткого диска - создавать и удалять разделы, форматировать, скрывать, перемещать их и изменять размеры.
Программа бесплатна в случае домашнего применения.
Скачать: http://soft.softodrom.ru/ap/EASEUS-Partition-Manager-Home-Edition-p7402

Если с загр диска ставить будете то там вас спросят но я встречал людей которые любили Партишеном форматить сначало а потом ещё раз при установке винды

Не спросят. Винда только в НТФС форматит. Если есть раздел в ФАТе, может просто его оставить, не переразмечая. Партишн мэйджиком тоже можно.

При переустановка Вас спросят в какую систему форматировать.

нужно, и акронис тож подойдёт