Конфигурирование разделов на жестком диске. Выбор файловой системы. -раскажите какие они бывают и в чем различия

Классификация файловых систем

По предназначению файловые системы можно классифицировать на следующие категории:
Для носителей с произвольным доступом (например, жёсткий диск) : FAT32, HPFS, ext2 и др. Поскольку доступ к дискам в разы медленнее, чем доступ к оперативной памяти, для прироста производительности во многих файловых системах применяется асинхронная запись изменений на диск. Для этого применяется либо журналирование, например в ext3, ReiserFS, JFS, NTFS, XFS, либо механизм soft updates и др. Журналирование широко распространено в Linux, применяется в NTFS. Soft updates — в BSD системах.
Для носителей с последовательным доступом (например, магнитные ленты) : QIC и др.
Для оптических носителей — CD и DVD: ISO9660, ISO9690, HFS, UDF и др.
Виртуальные файловые системы: AEFS и др.
Сетевые файловые системы: NFS, CIFS, SSHFS, GmailFS и др.
Для флэш-памяти: YAFFS, ExtremeFFS.
Немного выпадают из общей классификации специализированные файловые системы: ZFS (собственно файловой системой является только часть ZFS), VMFS (т. н. кластерная файловая система, которая предназначена для хранения других файловых систем) и др.

http://ru.wikipedia.org/wiki/ Файловая_система

Сначало надо освоить азы, а вы судя по вопросу не прочли ни одной книги. В трех словах такие понятия не объяснишь

Долго и нудно обяснять... просто форматируй в NTFS .и не думай о лишнем!

Fat32 самая быстрая система, но имеет ограничение на размер файлов не более 4Гб.
NTFS - чуть медленнее, но зато нет ограничений