Подскажите программу по созданию анимированных картинок, в которую можно вставлять видео-фрагменты.

Таких программ есть несколько. Выбирайте. Какая, больше по вкусу:

Video to GIF Converter
Это профессиональный видео конвертер, который превращает файлы AVI ( DivX, XviD, MS MPEG4, Uncompressed, Cinepak и др.) , файлы MPEG-1, MPEG-2, WMV или QuickTime в анимационные GIF-ы. Имея простой и удобный интерфейс для пользователя, приложение позволяет помимо конвертации изменить размер кадра, частоту кадров, яркость и сформировать соответствующий анимационных GIF на выходе.

Video Avatar
Инструмент для создания анимированных GIF аватаров и юзерпиков из любого видео файла. Вы выбираете видео файл, определенную его часть, и производите кадрирование для желаемого аватара или юзерпика. Так что это настоящая программа для видео кадрирования. Используя Video Avatar Вы можете создавать оригинальные видео аватары для блогов, журналов, дневников, а так же поместить аватар в разделе "о себе" на форумах, интернет сообществах и т. п.

VidGIF
Инструмент легкого и непринужденного превращения любого видео файла в GIF-анимацию в виде увлекательной аватары, анимированного логотипа для вебсайта или простого баннера, а также пригодно как "быстрое" решение веб-мастерам в их работе над проектом. VidGIF позволяет устанавливать необходимую высоту и ширину, количество кадров в секунду анимированного GIF. VidGIF очень легок в использовании, имеет дружелюбный интерфейс, поэтому ни у кого не должно возникнуть никаких проблем в управлении.

Ну, а если у Вас есть фотошоп, то и далеко ходить не надо. Просто, воспользуйтесь функцией импорта кадров видео в слои.. .

Удачи! :)

Power Point тоже подходит

Moovie Maker