Как на PHP получать пути к файлам из массива names в теге input при загрузке некольких файлов?

ну поскольку вы передаете файлы на сервер то вы как минимум должны использовать массив $_FILES в скрипте, обрабатывающем получение файла/ов.. . ну и в форме тоже дописать что вы передаете в ней файлы.. . далее вы загрузили файлы, и вы должны их скопировать по нужному вам пути из временной директории (move_upload_files или как-то так).. . ну и обращаться к файлам через $_FILES[ ' upload ' ] [ 1 ] [ ' filename ' ] - в зависимости от того что вам от файла надо...

input name="uploadfile1" type="file"
input name="uploadfile2" type="file"
input name="uploadfile3" type="file"

$_FILES['uploadfile1']['tmp_name']
$_FILES['uploadfile2']['tmp_name']
$_FILES['uploadfile3']['tmp_name']

либо как вы хотите (зачем не знаю)
$callup = upload('uploadfile1', $n1, $n2); //Вызываем функцию загрузки 1-го файлов, путь к файлу на компе пользователя передается через 'uploadfile1'
$callup = upload('uploadfile2', $n1, $n2); //Вызываем функцию загрузки 2-го файлов, путь к файлу на компе пользователя передается через 'uploadfile2'
$callup = upload('uploadfile3', $n1, $n2); //Вызываем функцию загрузки 3-го файлов, путь к файлу на компе пользователя передается через 'uploadfile3'

но можно и просто опять таки
$callup = upload('uploadfile[0]', $n1, $n2); //Вызываем функцию загрузки 1-го файлов, путь к файлу на компе пользователя
$callup = upload('uploadfile[1]', $n1, $n2); //Вызываем функцию загрузки 2-го файлов, путь к файлу на компе пользователя
$callup = upload('uploadfile[2]', $n1, $n2); //Вызываем функцию загрузки 3-го файлов, путь к файлу на компе пользователя

если в форме будет простое
form
input name="uploadfile[]" type="file"
input name="uploadfile[]" type="file"
input name="uploadfile[]" type="file"
input name="upload_btn" type="submit" value="Загрузить"
/form

заметьте что без номеров тут все!! !
и не забываем правило - первый элемент массива это элемент с номером ноль а не один!! !