Подскажите, как прописаться к мужу в общежитие мне и двоим нашим несовершеннолетним детям?

Зарегистрироваться и вселиться - разные вещи.
На проживание в общаге у Вашего мужа есть договор, вот в нем-то все и написано.
Требуется согласие руководителя - ну так получайте его.
В любом случае, общага - служебное жилье, Ваше право проживания там - производное от права супруга. Самостоятельных прав на пользование этой комнатой Вы не получите. Разводитесь с мужем - вылетаете из общаги без предоставления другого жилья. Предоставляют супругу (без учета семьи) жилье взамен этой общаги - тоже без учета вас. И даже если начальство общаги будет аргументировать, что, мол, мы Вас зарегистрируем, а Вы начнете бОльшую площадь требовать, ничего, такое право у Вас возникнет только лет через 5, т. к. Вы сознательно ухудшили свои жилищные условия, поселились на маленькой площади.
У меня был в практике случай - военнослужащий каждый год женился на новой женщине с ребенком, регистрировал их в своей комнате в общаге. Потом разводился. Набралось 2 БЖ. Когда ему отказали в регистрации третьей жены, он обжаловал, был суд, ему не разрешили. Жена - да, а регистрации - нет.

только зарегистрировать детей, а потом встать на очередь втроем

Вас Любовь там незарегистрируют, а вот детей он может зарегистрировать ..

А муж, то зарегистрирован, или так по случке попался, детей, что к себе не прописывает, и не надо, найдет лучшую, и какие нормы, дети в нормах или в разгильдяйстве, суд у вас есть или не той головкой думаете.

Ну вы экстрималы