зачем необходимо личное присутствие при регистрации

Постоянная регистрация (прописка) в этом случае оформляется Вами лично в соответствующих государственных службах, для оформления прописки достаточно вашего личного присутствия ...Гарантией легальности является ваше личное присутствие. Вы лично проходите все процедуры и инстанции, удостоверяетесь в легальности, получаете на руки все документы

Регистрации ЧЕГО?
При любом подобном акте чиновник ДОЛЖЕН убедится в том, что он регистрирует ЖИВОГО человека, а не его документы.

если речь идет о регистрации по месту жительства то регистрируется физическое тело на определенное место жительство (тоесть перемещение и учет тел по просторам России) а не подтвердающие ФИО этого субъекта документы (паспорт. военный билет и. т. д.)

Потому, что так написано в законе.
Но при этом замечу, что гражданин может делать это через представителя по доверенности. Единственное, что паспортисты об этом могут не знать.

РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ
ЗАКОН
О ПРАВЕ ГРАЖДАН РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
НА СВОБОДУ ПЕРЕДВИЖЕНИЯ, ВЫБОР МЕСТА ПРЕБЫВАНИЯ
И ЖИТЕЛЬСТВА В ПРЕДЕЛАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Статья 6. Регистрация гражданина Российской Федерации по месту жительства

Гражданин Российской Федерации, изменивший место жительства, обязан не позднее семи дней со дня прибытия на новое место жительства обратиться к должностному лицу, ответственному за регистрацию, с заявлением по установленной форме. При этом предъявляются:
паспорт или иной заменяющий его документ, удостоверяющий личность гражданина;
документ, являющийся основанием для вселения гражданина в жилое помещение (ордер, договор, заявление лица, предоставившего гражданину жилое помещение, или иной документ) , или его надлежаще заверенная копия.
Орган регистрационного учета обязан зарегистрировать гражданина по месту жительства не позднее трех дней со дня предъявления им документов на регистрацию.